MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 34052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014002	TAT	2	6	181630	181635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494839
3002	NC_014002	TTG	2	6	181799	181804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494839
3003	NC_014002	ATT	2	6	181919	181924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494839
3004	NC_014002	TGA	3	9	181950	181958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494839
3005	NC_014002	TAA	2	6	182045	182050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494839
3006	NC_014002	ATC	2	6	182062	182067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494839
3007	NC_014002	TTTC	2	8	182165	182172	0 %	75 %	0 %	25 %	294494840
3008	NC_014002	ATG	2	6	182226	182231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494840
3009	NC_014002	TC	3	6	182250	182255	0 %	50 %	0 %	50 %	294494840
3010	NC_014002	CAATTT	2	12	182269	182280	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294494840
3011	NC_014002	TAC	2	6	182296	182301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494840
3012	NC_014002	CCTGA	2	10	182312	182321	20 %	20 %	20 %	40 %	294494840
3013	NC_014002	AAT	2	6	182339	182344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494840
3014	NC_014002	TGA	3	9	182431	182439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494840
3015	NC_014002	ACA	2	6	182489	182494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494840
3016	NC_014002	TCC	2	6	182514	182519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494840
3017	NC_014002	ATC	2	6	182596	182601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494840
3018	NC_014002	CGA	2	6	182623	182628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494840
3019	NC_014002	CA	3	6	182777	182782	50 %	0 %	0 %	50 %	294494840
3020	NC_014002	ATC	2	6	182792	182797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494840
3021	NC_014002	AGT	2	6	182818	182823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494840
3022	NC_014002	GAGG	2	8	182852	182859	25 %	0 %	75 %	0 %	294494840
3023	NC_014002	TGA	2	6	183019	183024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494840
3024	NC_014002	AAC	2	6	183025	183030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494840
3025	NC_014002	CTGC	2	8	183128	183135	0 %	25 %	25 %	50 %	294494840
3026	NC_014002	TC	3	6	183138	183143	0 %	50 %	0 %	50 %	294494840
3027	NC_014002	CAG	2	6	183207	183212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494840
3028	NC_014002	GAAA	2	8	183241	183248	75 %	0 %	25 %	0 %	294494840
3029	NC_014002	CGC	2	6	183267	183272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294494841
3030	NC_014002	CTT	2	6	183277	183282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494841
3031	NC_014002	GAC	2	6	183325	183330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494841
3032	NC_014002	TCAA	2	8	183349	183356	50 %	25 %	0 %	25 %	294494841
3033	NC_014002	TCC	2	6	183438	183443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494841
3034	NC_014002	GTG	2	6	183485	183490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494841
3035	NC_014002	TAT	2	6	183516	183521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494841
3036	NC_014002	GCT	2	6	183553	183558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494841
3037	NC_014002	A	7	7	183663	183669	100 %	0 %	0 %	0 %	294494841
3038	NC_014002	ATT	3	9	183709	183717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494841
3039	NC_014002	TGG	2	6	183725	183730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494841
3040	NC_014002	CAG	2	6	183780	183785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494842
3041	NC_014002	TAT	2	6	183817	183822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494842
3042	NC_014002	TGG	2	6	183895	183900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494842
3043	NC_014002	TTC	2	6	183913	183918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494842
3044	NC_014002	CGG	2	6	183919	183924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294494842
3045	NC_014002	T	6	6	183943	183948	0 %	100 %	0 %	0 %	294494842
3046	NC_014002	A	6	6	184001	184006	100 %	0 %	0 %	0 %	294494842
3047	NC_014002	T	6	6	184022	184027	0 %	100 %	0 %	0 %	294494842
3048	NC_014002	CATCT	2	10	184075	184084	20 %	40 %	0 %	40 %	294494842
3049	NC_014002	A	6	6	184578	184583	100 %	0 %	0 %	0 %	294494843
3050	NC_014002	TAT	2	6	184607	184612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494843
3051	NC_014002	TA	3	6	184624	184629	50 %	50 %	0 %	0 %	294494843
3052	NC_014002	AGGA	2	8	184694	184701	50 %	0 %	50 %	0 %	294494843
3053	NC_014002	CTC	2	6	184744	184749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494843
3054	NC_014002	CAA	2	6	184753	184758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494843
3055	NC_014002	TAT	2	6	184901	184906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494843
3056	NC_014002	ATC	2	6	184923	184928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494843
3057	NC_014002	A	6	6	184983	184988	100 %	0 %	0 %	0 %	294494843
3058	NC_014002	GAA	2	6	185043	185048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494843
3059	NC_014002	TAT	2	6	185181	185186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494843
3060	NC_014002	GCT	2	6	185204	185209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494843
3061	NC_014002	CAGT	2	8	185234	185241	25 %	25 %	25 %	25 %	294494843
3062	NC_014002	TGG	2	6	185255	185260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494843
3063	NC_014002	ATC	2	6	185349	185354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494843
3064	NC_014002	A	6	6	185420	185425	100 %	0 %	0 %	0 %	294494843
3065	NC_014002	GAT	2	6	185619	185624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494843
3066	NC_014002	AGA	2	6	185699	185704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494844
3067	NC_014002	ATG	2	6	185728	185733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494844
3068	NC_014002	TGC	2	6	185759	185764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494844
3069	NC_014002	TA	3	6	185780	185785	50 %	50 %	0 %	0 %	294494844
3070	NC_014002	CAG	2	6	185799	185804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494844
3071	NC_014002	TTG	2	6	185890	185895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494844
3072	NC_014002	A	6	6	185926	185931	100 %	0 %	0 %	0 %	294494844
3073	NC_014002	CTGAT	2	10	186034	186043	20 %	40 %	20 %	20 %	294494844
3074	NC_014002	TTC	2	6	186063	186068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494844
3075	NC_014002	GGT	2	6	186120	186125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494844
3076	NC_014002	CA	3	6	186176	186181	50 %	0 %	0 %	50 %	294494844
3077	NC_014002	A	6	6	186190	186195	100 %	0 %	0 %	0 %	294494844
3078	NC_014002	A	6	6	186258	186263	100 %	0 %	0 %	0 %	294494844
3079	NC_014002	GAT	2	6	186303	186308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494844
3080	NC_014002	AT	3	6	186361	186366	50 %	50 %	0 %	0 %	294494845
3081	NC_014002	CAA	2	6	186422	186427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494845
3082	NC_014002	GAT	2	6	186429	186434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494845
3083	NC_014002	GA	3	6	186444	186449	50 %	0 %	50 %	0 %	294494845
3084	NC_014002	ACT	2	6	186460	186465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494845
3085	NC_014002	ATT	2	6	186508	186513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494845
3086	NC_014002	TCT	2	6	186599	186604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494845
3087	NC_014002	TAA	2	6	186611	186616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494845
3088	NC_014002	T	6	6	186682	186687	0 %	100 %	0 %	0 %	294494845
3089	NC_014002	AAC	2	6	186750	186755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494845
3090	NC_014002	GAAA	2	8	186923	186930	75 %	0 %	25 %	0 %	294494845
3091	NC_014002	TCC	2	6	187008	187013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494845
3092	NC_014002	AT	3	6	187024	187029	50 %	50 %	0 %	0 %	294494845
3093	NC_014002	TG	3	6	187108	187113	0 %	50 %	50 %	0 %	294494845
3094	NC_014002	CAT	2	6	187202	187207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494845
3095	NC_014002	TG	3	6	187270	187275	0 %	50 %	50 %	0 %	294494845
3096	NC_014002	AAGT	2	8	187306	187313	50 %	25 %	25 %	0 %	294494845
3097	NC_014002	GGA	2	6	187344	187349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494845
3098	NC_014002	GAT	2	6	187373	187378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494845
3099	NC_014002	TGTC	2	8	187391	187398	0 %	50 %	25 %	25 %	294494845
3100	NC_014002	GAT	2	6	187410	187415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494845
3101	NC_014002	GGA	2	6	187463	187468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494845
3102	NC_014002	GCC	2	6	187524	187529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294494845
3103	NC_014002	AGG	2	6	187546	187551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494845
3104	NC_014002	TAT	2	6	187632	187637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494845
3105	NC_014002	AAT	2	6	187683	187688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494845
3106	NC_014002	TTG	2	6	187690	187695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494845
3107	NC_014002	GGGA	2	8	187735	187742	25 %	0 %	75 %	0 %	294494845
3108	NC_014002	TTCATA	2	12	187794	187805	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294494845
3109	NC_014002	A	6	6	187851	187856	100 %	0 %	0 %	0 %	294494845
3110	NC_014002	GTCT	2	8	187861	187868	0 %	50 %	25 %	25 %	294494845
3111	NC_014002	AGG	2	6	187887	187892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494845
3112	NC_014002	TTGATA	2	12	187990	188001	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	294494845
3113	NC_014002	GT	3	6	188035	188040	0 %	50 %	50 %	0 %	294494845
3114	NC_014002	TTC	2	6	188048	188053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494845
3115	NC_014002	GAA	2	6	188151	188156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494846
3116	NC_014002	CAT	2	6	188302	188307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494846
3117	NC_014002	AAT	2	6	188383	188388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494846
3118	NC_014002	CTT	2	6	188430	188435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494846
3119	NC_014002	TGCC	2	8	188506	188513	0 %	25 %	25 %	50 %	294494846
3120	NC_014002	TAAG	2	8	188601	188608	50 %	25 %	25 %	0 %	294494846
3121	NC_014002	ACA	2	6	188618	188623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494846
3122	NC_014002	TAT	2	6	188650	188655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494846
3123	NC_014002	AT	3	6	188695	188700	50 %	50 %	0 %	0 %	294494846
3124	NC_014002	ATCTA	2	10	188775	188784	40 %	40 %	0 %	20 %	294494846
3125	NC_014002	GAA	2	6	188864	188869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494846
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3131	NC_014002	TCTTT	2	10	189062	189071	0 %	80 %	0 %	20 %	294494846
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3142	NC_014002	T	7	7	189975	189981	0 %	100 %	0 %	0 %	294494848
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3243	NC_014002	CGT	2	6	195435	195440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494852
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3352	NC_014002	TGC	2	6	201030	201035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494857
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3354	NC_014002	GAG	2	6	201139	201144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494857
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3357	NC_014002	AGTGA	2	10	201307	201316	40 %	20 %	40 %	0 %	294494857
3358	NC_014002	ATG	2	6	201395	201400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494857
3359	NC_014002	GCT	2	6	201412	201417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494857
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3362	NC_014002	CGC	2	6	201774	201779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294494858
3363	NC_014002	CA	3	6	201842	201847	50 %	0 %	0 %	50 %	294494858
3364	NC_014002	A	7	7	201854	201860	100 %	0 %	0 %	0 %	294494858
3365	NC_014002	GAT	2	6	201867	201872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494858
3366	NC_014002	TTG	2	6	201997	202002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494858
3367	NC_014002	AAC	2	6	202006	202011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494858
3368	NC_014002	CATG	2	8	202041	202048	25 %	25 %	25 %	25 %	294494858
3369	NC_014002	GTTACC	2	12	202138	202149	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294494858
3370	NC_014002	GAT	2	6	202239	202244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494858
3371	NC_014002	GGC	2	6	202298	202303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294494858
3372	NC_014002	GATT	2	8	202317	202324	25 %	50 %	25 %	0 %	294494858
3373	NC_014002	T	7	7	202332	202338	0 %	100 %	0 %	0 %	294494859
3374	NC_014002	CCCAG	2	10	202344	202353	20 %	0 %	20 %	60 %	294494859
3375	NC_014002	TAT	2	6	202363	202368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494859
3376	NC_014002	AT	3	6	202421	202426	50 %	50 %	0 %	0 %	294494859
3377	NC_014002	TCA	2	6	202505	202510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494859
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3380	NC_014002	TC	3	6	202926	202931	0 %	50 %	0 %	50 %	294494859
3381	NC_014002	CAT	2	6	203019	203024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494859
3382	NC_014002	TTC	2	6	203119	203124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494859
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3385	NC_014002	CTG	2	6	203242	203247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494859
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3392	NC_014002	GAA	2	6	204084	204089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494861
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3484	NC_014002	AT	3	6	208721	208726	50 %	50 %	0 %	0 %	294494865
3485	NC_014002	CGG	2	6	208732	208737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294494865
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3488	NC_014002	TGCAGG	2	12	209064	209075	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294494866
3489	NC_014002	TTG	2	6	209093	209098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494866
3490	NC_014002	GAC	2	6	209182	209187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494867
3491	NC_014002	CTT	2	6	209261	209266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494867
3492	NC_014002	GAA	2	6	209384	209389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494867
3493	NC_014002	TGA	2	6	209500	209505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494867
3494	NC_014002	GAA	2	6	209513	209518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494867
3495	NC_014002	AGA	2	6	209596	209601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494867
3496	NC_014002	GTT	2	6	209666	209671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494868
3497	NC_014002	CGG	2	6	209686	209691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294494868
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3499	NC_014002	GTT	2	6	209756	209761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494868
3500	NC_014002	TGA	2	6	209827	209832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494868

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